Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms