Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIN1Q9NXP7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIN1Q9NXP7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms