Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms