Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms