Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms