Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms