Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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