Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms