Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms