Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms