Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA5Q9BWX5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA5Q9BWX5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms