Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms