Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms