Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms