Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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