Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms