Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD1Q96JS3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms