Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CELF6Q96J87 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms