Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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RNF185Q96GF1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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RNF185Q96GF1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF185Q96GF1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF185Q96GF1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RNF185Q96GF1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF185Q96GF1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF185Q96GF1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF185Q96GF1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF185Q96GF1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF185Q96GF1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF185Q96GF1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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