Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms