Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms