Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms