Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms