Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms