Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARMIL3Q8ND23 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARMIL3Q8ND23 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms