Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FAM71DQ8N9W8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71DQ8N9W8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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