Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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