Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms