Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NPHP3Q7Z494 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPHP3Q7Z494 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms