Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms