Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms