Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms