Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms