Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms