Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms