Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms