Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms