Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms