Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALFQ53S48 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms