Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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