Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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