Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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