Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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CRY1Q16526 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CRY1Q16526 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CRY1Q16526 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CRY1Q16526 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CRY1Q16526 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CRY1Q16526 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CRY1Q16526 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRY1Q16526 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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