Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms