Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRK1Q15835 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms