Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC1A5Q15758 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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