Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms