Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SYCP1Q15431 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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