Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms