Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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